哥哥愛德華和弟弟阿爾馮斯為了再次見到逝去的母親，決定挑戰(zhàn)煉金術(shù)最大的禁忌——人體煉成。但因?yàn)闊挸墒?，愛德華失去了左腳，弟弟喪失了整個(gè)身體。哥哥不惜用自己的右臂為代價(jià)救回了差點(diǎn)被吞沒的阿爾方斯的靈魂，將他固定到一副鎧甲上。錯(cuò)已鑄成，兄弟倆為了恢復(fù)原來的身體開始一起尋找傳說中孕育著無窮力量的“賢者之石”，踏上了冒險(xiǎn)和成長之途。