《潛艇總動員：外星寶貝計劃》講述在企鵝教授和海豹鎮(zhèn)長的宣傳帶領(lǐng)下，海底社會認同了“外星人有害論”的觀點。小潛艇阿力偶然遇到來地球游玩卻和父母走散的小外星人WUGU，通過了解阿力發(fā)現(xiàn)外星人不但不危險，還很友好。為了幫助WUGU找到父母，阿力和朋友貝貝克服了重重阻礙，揭穿了企鵝教授的陰謀，成功送WUGU回了家。最終，海底生物和外星人成為了朋友，海洋世界再一次恢復(fù)了平靜。